MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Flavobacterium branchiophilum FL-15 plasmid pFB1

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018751	GCTTT	2	10	6	15	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018751	T	6	6	13	18	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018751	AAT	2	6	25	30	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018751	ATA	2	6	49	54	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409183165
5	NC_018751	GACT	2	8	68	75	25 %	25 %	25 %	25 %	409183165
6	NC_018751	TAG	2	6	98	103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409183165
7	NC_018751	A	6	6	104	109	100 %	0 %	0 %	0 %	409183165
8	NC_018751	T	6	6	113	118	0 %	100 %	0 %	0 %	409183165
9	NC_018751	ATC	2	6	124	129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409183165
10	NC_018751	AAG	2	6	131	136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409183165
11	NC_018751	TTTG	2	8	168	175	0 %	75 %	25 %	0 %	409183165
12	NC_018751	TGGT	2	8	328	335	0 %	50 %	50 %	0 %	409183165
13	NC_018751	A	6	6	364	369	100 %	0 %	0 %	0 %	409183165
14	NC_018751	AGAGGT	2	12	378	389	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	409183165
15	NC_018751	A	7	7	393	399	100 %	0 %	0 %	0 %	409183165
16	NC_018751	A	6	6	625	630	100 %	0 %	0 %	0 %	409183165
17	NC_018751	A	6	6	637	642	100 %	0 %	0 %	0 %	409183165
18	NC_018751	GAA	2	6	685	690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409183165
19	NC_018751	A	7	7	689	695	100 %	0 %	0 %	0 %	409183165
20	NC_018751	CGGT	2	8	696	703	0 %	25 %	50 %	25 %	409183165
21	NC_018751	ATT	2	6	726	731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409183165
22	NC_018751	AC	3	6	740	745	50 %	0 %	0 %	50 %	409183165
23	NC_018751	ACA	2	6	806	811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409183165
24	NC_018751	TCC	2	6	854	859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409183165
25	NC_018751	CTA	2	6	998	1003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409183165
26	NC_018751	GAAAAA	2	12	1027	1038	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	409183165
27	NC_018751	ATG	2	6	1046	1051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409183165
28	NC_018751	TGAT	2	8	1055	1062	25 %	50 %	25 %	0 %	409183165
29	NC_018751	GGT	2	6	1203	1208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409183166
30	NC_018751	TGT	2	6	1245	1250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409183166
31	NC_018751	CTTC	2	8	1262	1269	0 %	50 %	0 %	50 %	409183166
32	NC_018751	TCC	2	6	1342	1347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409183166
33	NC_018751	ACA	2	6	1355	1360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409183166
34	NC_018751	GTT	2	6	1394	1399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409183166
35	NC_018751	T	6	6	1426	1431	0 %	100 %	0 %	0 %	409183166
36	NC_018751	T	6	6	1446	1451	0 %	100 %	0 %	0 %	409183166
37	NC_018751	T	6	6	1639	1644	0 %	100 %	0 %	0 %	409183166
38	NC_018751	CTT	2	6	1665	1670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409183166
39	NC_018751	T	8	8	1727	1734	0 %	100 %	0 %	0 %	409183167
40	NC_018751	TGG	2	6	1800	1805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409183167
41	NC_018751	ATT	2	6	1976	1981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409183167
42	NC_018751	TCA	2	6	1995	2000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409183167
43	NC_018751	TCA	2	6	2049	2054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409183167
44	NC_018751	AGA	2	6	2064	2069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409183167
45	NC_018751	TCGTTA	2	12	2085	2096	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	409183167
46	NC_018751	T	8	8	2171	2178	0 %	100 %	0 %	0 %	409183167
47	NC_018751	TTTC	2	8	2182	2189	0 %	75 %	0 %	25 %	409183167
48	NC_018751	CAA	2	6	2212	2217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409183167
49	NC_018751	GGAA	2	8	2237	2244	50 %	0 %	50 %	0 %	409183167
50	NC_018751	TAT	2	6	2272	2277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409183167
51	NC_018751	CA	3	6	2312	2317	50 %	0 %	0 %	50 %	409183167
52	NC_018751	AAT	2	6	2335	2340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018751	GCA	2	6	2345	2350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018751	TTTA	2	8	2481	2488	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018751	A	9	9	2490	2498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018751	AAAT	2	8	2527	2534	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018751	TAG	2	6	2549	2554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409183168
58	NC_018751	A	8	8	2575	2582	100 %	0 %	0 %	0 %	409183168
59	NC_018751	GAA	2	6	2730	2735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409183168
60	NC_018751	AGA	2	6	2759	2764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409183168
61	NC_018751	CAAA	2	8	2813	2820	75 %	0 %	0 %	25 %	409183169
62	NC_018751	A	6	6	2840	2845	100 %	0 %	0 %	0 %	409183169
63	NC_018751	AGA	2	6	2887	2892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409183169
64	NC_018751	GAA	2	6	2951	2956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409183169
65	NC_018751	GAA	2	6	3008	3013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409183169
66	NC_018751	ATT	2	6	3048	3053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409183169
67	NC_018751	GTAT	2	8	3060	3067	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018751	TCAA	2	8	3117	3124	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_018751	T	12	12	3130	3141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018751	T	7	7	3163	3169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018751	AAC	2	6	3186	3191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018751	A	6	6	3195	3200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018751	T	10	10	3203	3212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018751	T	6	6	3216	3221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018751	AGT	2	6	3228	3233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018751	CTAAC	2	10	3320	3329	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
77	NC_018751	T	8	8	3360	3367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018751	TTA	2	6	3375	3380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018751	TTAT	2	8	3398	3405	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.